| No. | Nama Unit dan Keterangan | Akreditasi dan Nilai | Tanggal Berakhir |
| 1 | Nama Unit : Sekolah Tinggi Agama Islam Negeri Pamekasan Nomor SK : 849/SK/BAN-PT/Ak-SURV/PT/VIII/2015 Tgl. Akreditasi : 15 Mei 2015 | Status : berlaku | B | 15 Mei 2020 |
| 2 | Nama Unit : S1 - Pendidikan Agama Islam 2007-2012 Nomor SK : 030/BAN-PT/Ak-X/S1/XII/2007 Tgl. Akreditasi : 14 Desember 2007 | Status : kadaluarsa | B | 14 Desember 2012 |
| 3 | Nama Unit : S1 - Pendidikan Agama Islam 2013-2018 Nomor SK : 174/SK/BAN-PT/Ak-XVI/S1/XIII/2013 Tgl. Akreditasi : 24 Agustus 2013 | Status : kadaluarsa | B | 24 Agustus 2018 |
| 4 | Nama Unit : S1 - Pendidikan Agama Islam 2018-2023 (STAIN Pamek Nomor SK : 2405/SK/BAN-PT/Akred/S/VIII/2018 Tgl. Akreditasi : 27 Agustus 2018 | Status : berlaku | A | 27 Agustus 2023 |
| 5 | Nama Unit : S1 - Pendidikan Bahasa Arab Nomor SK : 211/SK/BAN-PT/Ak-XVI/S/X/2013 Tgl. Akreditasi : 19 Oktober 2013 | Status : berlaku | B | 19 Oktober 2018 |
| 6 | Nama Unit : S1 - Ahwal Al-Syakhshiyah 2008-2013 Nomor SK : 018/BAN-PT/Ak-XI/S1/VIII/2008 Tgl. Akreditasi : 14 Agustus 2008 | Status : kadaluarsa | B | 14 Agustus 2018 |
| 7 | Nama Unit : S1 - Ahwal Al-Syakhshiyah 2014-2019 Nomor SK : 053/SK/BAN-PT/Akred/S/II/2014 Tgl. Akreditasi : 1 Pebruari 2014 | Status : kadaluarsa | B | 31 Januari 2019 |
| 8 | Nama Unit : S1 - Ahwal Al-Syakhshiyah 2018-2023 Nomor SK : 3522/SK/BAN-PT/Ak-PNB/S/XII/2018 Tgl. Akreditasi : 9 Juli 2018 | Status : berlaku | A | 9 Juli 2023 |
| 9 | Nama Unit : S1 - Tadris Bahasa Inggris 2011-2016 Nomor SK : 028/BAN-PT/Ak-XIV/S1/X/2011 Tgl. Akreditasi : 7 Oktober 2011 | Status : kadaluarsa | C | 7 Oktober 2016 |
| 10 | Nama Unit : S1 - Tadris Bahasa Inggris Nomor SK : 118/SK/BAN-PT/Akred/S/III/2015 Tgl. Akreditasi : 28 Maret 2015 | Status : berlaku | B | 28 Maret 2020 |
| 11 | Nama Unit : S1 - Perbankan Syariah 2013-2018(STAIN Pamekasan) Nomor SK : 192/SK/BAN-PT/Ak-XVI/S/IX/2013 Tgl. Akreditasi : 21 September 2013 | Status : kadaluarsa | B | 21 September 2018 |
| 12 | Nama Unit : S1 - Perbankan Syariah Nomor SK : 2106/SK/BAN-PT/Akred/S/VIII/2018 Tgl. Akreditasi : 1 Agustus 2018 | Status : berlaku | B | 1 Agustus 2023 |
| 13 | Nama Unit : S1 - Hukum Ekonomi Syariah 2018-2022 Nomor SK : 3523/SK/BAN-PT/Ak-PNB/S/XII/2018 Tgl. Akreditasi : 10 Oktober 2017 | Status : berlaku | B | 22 Oktober 2022 |
| 14 | Nama Unit : S1 - Manajemen Pendidikan Islam (STAIN Pamekasan) Nomor SK : 3840/SK/BAN-PT/Akred/S/X/2017 Tgl. Akreditasi : 17 Oktober 2017 | Status : berlaku | B | 17 Oktober 2022 |
| 15 | Nama Unit : S1 - Ekonomi Syariah 2017-2022 (STAIN Pamekasan) Nomor SK : 4742/SK/BAN-PT/Akred/S/XVII/2017 Tgl. Akreditasi : 12 Desember 2017 | Status : berlaku | B | 12 Desember 2022 |
| 16 | Nama Unit : S2 - Pendidikan Agama Islam Nomor SK : 1214/SK/BAN-PT/Ak-SURV/M/XII/2015 Tgl. Akreditasi : 27 Juni 2015 | Status : berlaku | B | 27 Juni 2020 |
| 17 | Nama Unit : S1 - Ilmu Alquran dan Tafsir Nomor SK : 141/SK/BAN-PT/Akred/S/II/2019 Tgl. Akreditasi : 19 Pebruari 2019 | Status : berlaku | B | 19 Pebruari 2024 |
| 18 | Nama Unit : S1 - Ekonomi Syariah 2018-2022 (IAIN Madura) Nomor SK : 3524/SK/BAN-PT/Ak-PNB/S/XII/2018 Tgl. Akreditasi : 7 April 2018 | Status : berlaku | B | 12 Desember 2022 |
| 19 | Nama Unit : Institut Agama Islam Negeri Madura Nomor SK : 326/SK/BAN-PT/Ak-PNB/PT/XI/2018 Tgl. Akreditasi : 7 April 2018 | Status : berlaku | B | 15 Mei 2020 |
| 20 | Nama Unit : S1 - Manajemen Pendidikan Islam (IAIN Madura) Nomor SK : 3521/SK/BAN-PT/Ak-PNB/S/XII/2018 Tgl. Akreditasi : 7 April 2018 | Status : berlaku | B | 17 Oktober 2022 |
